1941年
1月共赣西南特委从赣州迁往吉安并在赣州设立工作指导站，由特委宣传部长周易负责，以加强对赣县、于都、兴国、赣州等地组织的领导。7月，周易被捕，指导站停止活动。
2月下旬 由于国民党的清乡和“围剿”，中共三南中心县委与赣南特委从此中断了联系。
2月 为加强对赣县、于都、兴国等县党组织的领导，经中共江西省委批准，中共赣州中心县委成立，谭汤池任书记，机关驻赣州北郊水西龙庄上(后迁赣县江口圩小均坑村)，隶属于中共赣西南特委领导。中心县委原定辖赣州、于都、兴国等地党组织，但因各地党组织遭受破坏，实际只辖原赣县县委的江口、河西、五云等3个区委和于都钨矿区委。8月，书记谭汤池被叛徒李照贤骗至吉安被捕，中共赣州中心县委和下属党组织遭破坏。
2月蒋经国公开动员“进剿”赣南共产党组织。月底，调集重兵对原游击区进行驻剿，杀害中共干部、党员及其家属，并实行保甲联坐。赣南党组织再次受到严重损失。3月，中共赣南特委遵照中共广东省委指示，将已暴露身份的干部向外地疏散。
5月中共赣西南特委在赣州设立指挥部，领导开展党的地下活动。
6月7日中共中央对老苏区老游击区的工作提出了“长期埋伏，积蓄力量，等待时机”方针，要求隐蔽组织，避免打击，一般不与国民党作武装斗争，但应保存枪支，同时规定党内一般不采取设小组、支部、区委、县委等组织，党员个别联系，以普通社会人士名义出现，多办公益事业，在群众中树立威信，巩固自己的社会地位。
7月中共赣南特委坚持武装自卫斗争一年多，终未打破国民党当局的清乡和武装进攻，损失惨重。为保存力量，根据粤北省委指示，刘建华率领朱赞珍、李绪龙等特委部分同志撤离赣南。赣南特委停止活动。
7月继国民党特务破坏江西省委后，中共赣南特委及所属赣南县委全遭破坏。
8月 中共赣州中心县委书记谭汤池被捕，押送到泰和马家洲留训所半个月后，越狱逃跑，潜回到赣县江口、五云一带进行隐蔽活动。后因中共江西省委和赣西南特委遭破坏，中心县委停止了活动。
8月中国工业合作协会总会派陈志昆来赣州，营救被捕工合干部，并任东南工合办事处主任。冬，中共粤北省委委派叶德光、毕平非、吴志因等党员先后到东南工合办事处开展活动。他们一直坚持到1945年7月。
9月14日 由于国民党的清乡和进剿，中共信丰县委与特委失去联系，县委书记被捕，县委遭受破坏，停止活动。
10月16日日机7架轰炸龙南县城，投弹29枚(其中燃烧弹一枚)，炸毁房屋33栋，计319间,城乡居民死伤132人(其中伤亡80人)。
12月1日中共南方工作委员会决定，调任中共粤北省委秘书长。刘建华等同志转至东江地区进行敌后抗日游击斗争。